C'è già un caso simile nel forum.
Io nella sezione Generatore metterei semplicemente i due generatori.
Se gli impianti sono rimasti distinti, se cioè non sono collegati idraulicamente, farei due zone, ciascuna con la propria caldaia, emissione, distibuzione, ecc.
Se invece sono stati uniti, metterei le due caldaie a livello di edificio una dopo l'altra (bisognerebbe capire con che priorità partono, e se una tale cosa è gestita!!)
Per ACS farei una sola zona con area pari alla somma.