Secondo il mio parere, se quando ti sei recato con il progetto nel mese di giugno, lo stesso non ti è stato protocollato oppure non è stata protocollata la lettera di presentazione circa l'intervento da farsi, allora sarai costretto a rifarlo con i nuovi accorgimenti del DPR 59/09. Se invece sì, fa fede la legge vigente al momento del protocollo, indipendentemente dalla data della tua asseverazione di conformità dei lavori da presentare a fine settembre e quindi valgono le scelte progettuali dettate dalla 192 e dal 311..